实验中心为东南大学建筑学院与东南大学城市与建筑遗产保护教育部重点实验室联合建设的跨学科实验机构。依托国家985、211工程和江苏省优势学科建设项目，已建立起较为完善的覆盖建筑学、城市规划和景观三个一级学科的实验能力。实验中心下设实验室包括：
    城市与建筑遗产保护实验室
    建筑物理实验室
    建筑运算与应用实验室 
    现代建筑建造实验室
    GIS及CAAD国家专业实验室